
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化表达血清组学产品,实现1000+举重若轻度掩盖位点验出,保持稳定复现经典之作靶点,全东南方向生信研究分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“知道”到“安全验证”全具体流程服务保障,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、检测方案
02、实际数据分析
03、经“点”重演
在实际数据资料中,验出个专著中报导的經典靶点以至于衣康酸装饰语位点,如首个个被挖掘的衣康酸共价装饰语淀粉酶KEAP1,再有糖酵解信号通路中的3个根本酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,和炎性小体组合成淀粉酶NLRP3和肿瘤细胞损伤环节中的根本淀粉酶RIPK3等,其质谱图正确图图示。
04、好产品优点
1.多种质控
餐饮业化活性聊天测试探针孵育、SDS-PAGE测试、WB效验、范本相关的性概述等各种位测试,切实保障工作报告牢靠性。2.高功效质谱测量仪器公司
在Orbitrap Astral全新第二代高分辩质谱仪支持下,完成衣康碱化修饰语位点及蛋白质判定新纵深,促动科学的研究分析新察觉到。3.全步骤流程一趟式服务质量
鉴于拜谱生物学进一步完善的实践手机平台,可出具“上皮细胞陪养→的测试器孵育→WB的测试→什么难以理解的度衣康酸性反应淡化的测试→专有生信研究→某个位点PRM证实”全步骤流程业务,省时省时更放心。05、了解相关内容(方面)
06、利用放向
PART 2、论文分享视频
医学文献一
英文音标关键词:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
汉语问题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
实验方面:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
参考文献二
英文版子标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
常常标题文字:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
研发知识:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、成功案例ip产业工作思路
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13有着强大的底物紧密结合意识,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱生物体衣康硝化作用绘制组亲测数据信息中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康碱化装饰(详细图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱总结ppt
看作TCA嵌套循环中的中间的细胞基础代谢率物,衣康酸调理细胞基础代谢率、免疫抗体系统细胞和真菌感染病变主动间的主动用途,为开展免疫抗体系统细胞真菌感染病变性疾患保证了代用开展对策。衣康酸格局中的亲电性α,β-不达到饱和状态羧酸格局能对血清质含量质上的活性酶类半胱氨酸残基来烷基化遮盖语(迈克尔增加化学反应),这一种译成后遮盖语被称作“衣康酸遮盖语(itaconation)”,而能印象血清质含量质模块,控制免疫抗体系统细胞回复和细胞基础代谢率行业,为各种各样疾患治疗药物新产品研发保证新方法。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应绘制血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物药学绝按量靶向疗法代谢率组(QMT1000)或热量消化吸收靶向疗法消化吸收组物品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
选取期刊论文
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.