草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿控制机系统里普通的重大疾病一个。肾企业中CaOx尖晶石过饱和状态生成会促使肾小管细胞系损坏和凋亡，最终得以促使肾结石的生成。短链皮下脂肪多酸由肠胃内活性污泥法大肠杆菌发醇合理膳食植物纤维呈现，不单在身体局部肠胃防线中激发角色，另一方面在控制机系统总体水平上也激发首要角色。在这当中，丁酸是最充足的短链皮下脂肪多酸，享有免疫抗体抑止和免疫抗体抑止角色,本的研究初探丁酸对CaOx肾结石的角色还有其潜在性的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山机构泌尿整形科吴忠副教授、周子健研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教受、周子健博士生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了微信网络药理学学工作，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

文章内容称呼：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 潜在客户标准：华山医院专家 学习的对象：大鼠、HK-2癌细胞 排序产品信息：差表组（Con）、模形组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱出具新技术：互联网药学学在线检测

指导思想程序步骤

研究方案报告

分析人员管理第一创建大鼠仿真整治，经过生理性生化模式公式和组建病理报告学染料等分析措施看见丁酸也可以增多CaOx仿真整治大鼠肾CaOx单晶体的成型和直接板材损害，有效改善CaOx仿真整治大鼠的疾病直接板材损害和防腐蚀产物的过头理解。再者，丁酸还可控制草酸引诱的HK-2神经细胞膜直接板材损害、防腐蚀应激性和神经细胞膜凋亡。 为蜡烛燃烧实验丁酸组成部分和靶遗传染色体在线，研究方案者从PubChem获得丁酸和丁酸酯的二维和三维空间组成部分（图1A）。能够PharmMapper资料显示库和Uniprot资料显示库解决后共淘汰出1115个丁酸靶遗传染色体供进一次深入研究了解。将遗传染色体列表页添加STRING资料显示库，实行PPI在线深入研究了解。Cytoscape明确了去重复的前20的核心区站靶遗传染色体的简略在线图，涉及到CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。哪些核心区站遗传染色体与在线中的另一个遗传染色体均体现出一些 的关于性，这说明哪些遗传染色体几率展现着协同管理用途。GO和KEGG深入研究了解蕴含了丁酸核心区站遗传染色体的关于经过和怪物学技能（图1C）。核心区站遗传染色体大部分与类固醇雌抗生素对答、腐蚀应激反映状态对答、抗逆性酶类氧受损细胞对类固醇雌抗生素激起的反映已经对含酸性检查是否元素的反映想关。由此可见提出的，哪些核心区站遗传染色体大部分参与性了腐蚀应激反映状态和对抗逆性酶类氧的怪物反映期间，是肾结石形成了策略中至关极为重要的的经过，这意味着丁酸几率在肾结石中展现极为重要的用途。

图1| 丁酸框架与靶DNA电脑网络定性分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为拓宽渠道一个脚印探求丁酸对CaOx肾结石事实上切靶表观遗传，探索工作员根据GEO数据源剖析库对GSE73680中正常比较与CaOx肾结石病号的表观遗传差别的完成了探索。比较组与CaOx结石病号的可观性能差别的表明表观遗传（DEGs）肿瘤筛查标准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共淘汰到3783个表观遗传造成可观不同，这里面3379个（89.4%）表观遗传表明上浮，404个（10.6%）表观遗传表明下跌（图2A）。对DEGs完成聚类分析法剖析剖析，热图现示了前10个被选中DEGs的二维层次分割聚类分析法剖析显著特点（图2B）。之后，探索工作员经由GeneCards数据源剖析库工人监定了370个几率与CaOx肾结石涉及到的的表观遗传，排榜前20位的預测表观遗传及涉及到的性评定如同2C表达。主要在于寻找丁酸冶疗CaOx肾结石的主要靶点，探索工作员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石涉及到的表观遗传净化处理受到好几回个Venn图。最中，CYP2C9被选择为丁酸直接影响CaOx肾结石的因素靶点(图2D)。再者，探索工作员还完成了丁酸与CYP2C9的团伙接管，CYP2C9的四个氨基残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸互为意义，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在应用网络信息药学学預测CYP2C9是丁酸影向CaOx肾结石的靶遗传基因后，探究工作人员还使用細胞进行实验断定了CYP2C9可消减草酸介导的HK-2細胞的ROS情况、感染影响和凋亡。

图2| 多半据库协力分折预测分析CYP2C9是丁酸意义于CaOx肾结石的靶基因组

论述报告单

本研究分析先得知丁酸在身体和身体里均能减缓CaOx肾结石模形的钝化应激反应反应和宫颈宫颈细菌感染软组织影响，随后不久顺利利用电脑网上药剂学学淘汰实现丁酸印象CaOx肾结石的未知靶点——CYP2C9，第四顺利利用组织实验所验证CYP2C9在草酸盐引发的HK-2组织ROS平均水平、宫颈宫颈细菌感染软组织影响和凋亡。此类得知证明丁酸或许顺利利用减缓CYP2C9来减缓CaOx肾结石的钝化应激反应反应，降低宫颈宫颈细菌感染软组织影响。相应具体步骤中拜谱动物提供了了电脑网上药剂学学新方法功能，于此拜谱动物可提升改进改进的什么是基因组学、蛋白酶质组学、新陈代谢组学等几组学厂品及新方法功能，祝贺打电话咨询中心！ 参看文章：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.