
2024年9月由苏州林果业读书张万刚先生精英团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱动物为该研究提供了亚硝基化突显组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文名标题格式:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
学术期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202几年影响力指数:5.7
发表论文时候:2024年9月
朋友单位名称:南京农业大学
调查物料:蛋白
拜谱提拱技术性:亚硝基化修饰组学
技木交通路线:
一、深入分析結果
01.Caspase-3化学活化
到目前为止尚不很清楚NO对caspase-3的减缓做用什么情况下归因于NO介导的S-亚硝基化,不一样的盐浓度等度的GSNO看做外源性NO生产,以诱导型caspase-3的休外S-亚硝基化。毕竟发现,与如果没有GSNO的组差距,100、200和400μM GSNO组的caspase-3吸附性不错影响(图1),与前者新闻稿件高度。GSNO补救影响caspase-3吸附性的潜在性的的原因仍存在不足阐述。
图1 各个溶液浓度的GSNO工作对caspase-3活力性的会影响
02.Caspase-3的S-亚硝基化数量
探析Caspase-3的亚硝基化数量,以揭示GSNO对Caspase-3的发应性。经GSNO处理后,的检测工具到caspase-3蛋白酶S-亚硝基化力度加强(图2)。哪些最后取决于,外源性GSNO激发可成功的诱导性caspase-3的离体S-亚硝基化。更让人咋舌的是,在如果没有GSNO现实存在的照表组中的检测工具到的细小的S-亚硝基化带,这取决于caspase-3有机会突发内源性的S-亚硝基化。不仅而且,本探析中caspase-3的S-亚硝基化数量较高,而caspase-3的活性氧减轻,这与在之前的探析共同。虽然,caspase-3的特男人S-亚硝基化掩盖位点尚不了解清楚,还必须要进十步的生命的进化。
图2 GSNO清理对caspase-3S-亚硝基化水平面的损害
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化表达组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的队列。天蓝色箭头符号的队列透露S-亚硝基化肽,红色的箭头符号的C透露S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3光降解结蛋白质
结蛋清酶用于的一种根本的生殖细胞系骨架蛋清酶,在达到肌生殖细胞系构成设计的构成设计详细性和弯曲性问题起着根本反应,设计S-亚硝基化caspase-3对结蛋清酶挥发的敏感脆弱性极具根本实际意义。与Std(未用胱天蛋清酶酶-3和GSNO孵育的初使肌仟维蛋清酶)组相比较,0 μM GSNO组(肌原仟维和caspase-3的孵育,无GSNO)的详细结蛋清酶成分重要降低了,建议caspase-3对结蛋清酶极具因素的蛋清酶血清质水解的能力。在GSNO孵育后,详细结蛋清酶的成分特别增添(P < 0.05)。前者,当GSNO氨水浓度提高时,详细结蛋清酶的成分定期上涨(P < 0.05)(图5)。此看见表达,SNO修饰语的caspase-3以含量依耐的方式方法抑制作用结蛋清酶的挥发。
图5.S-亚硝基化caspase-3挥发结蛋白酶
05.S-亚硝基化Caspase- 3光降解肌钙球蛋白-T
肌钙核淀粉酶-T (TnT)是原肌球核淀粉酶调整否则健身肌肉膨胀的细条的所需肌原玻纤核淀粉酶。TnT的可生物可光生物降解结构特征是探测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化的条件下,caspase-3对TnT的可生物可光生物降解环境如下图6如图是,与Std组(不含有caspase-3和GSNO的肌原玻纤)相对来说,caspase-3组中30 kDa TnT场面有分明增长,意味着caspase-3体验了TnT的可生物可光生物降解,还有就是,caspase-3与GSNO的孵育引致30 kDa TnT变低。在100和200 μM GSNO组相互之间找不到探测到分明的对比分析(P > 0.05),而当GSNO的氧化还原电位达标400 μM 时,该场面有分明减低(P < 0.05)。这么多找到意味着了SNO遮盖的caspase-3对TnT可生物可光生物降解的促使的作用。结核淀粉酶和TnT是caspase-3的明感底物,而GSNO整理消减caspase-3的活性酶氧将会引致肌原玻纤核淀粉酶可生物可光生物降解水平消减。上面所论,NO介导的S-亚硝基化都可以能够遮盖半胱氨酸残基来调整caspase-3的活性酶氧,接着进步骤干扰其对结核淀粉酶和TnT的核淀粉酶淀粉水解专业能力,所以干扰羊肉高品质。
图6. S-亚硝基化caspase- 3光降解肌钙血清-T
二、总结ppt
本研究综述为了更好地研究综述S-亚硝基化对caspase-3表达语的损害十分那么对羊肉肌原玻纤身体外光降解的损害。血清S-亚硝基化能表达语caspase-3的半胱氨酸残基,于是导至caspase-3亲水性降低了,下一步一个脚印可抑制了其对羊肉肌原玻纤血清的血清水解反应业务能力。三、拜谱总结ppt
学习用于了酶活测定方法,亚硝基化呈现组学阐述,WB等检验行为,发现了血清酶S-亚硝基化不错呈现caspase-3的半胱氨酸残基,这造成 了caspase-3活性酶的减小,齐头并进步骤阻止了其对鸡肉肌原钎维血清酶的血清酶电离功能。本学习为解答血清酶质亚硝基化对口感的改善体制提供了一堆个新的第一人称。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的蛋清质组学、遮盖蛋清质组学、产生组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸全系列的产品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total阳极氧化呈现、矿酸巯基,欢迎大家咨询!
符合文献:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663