
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物技术 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究探讨成果
研究分析工作员探讨跟着冷冻箱日期拉长了牛羊肉片的密度、持水实力、色调、矿酸铁成分、ROS、脂质过金属氧化物物、MDA、GSH和GPX4技术来鉴定身体肌肉集体肿瘤人体细胞的铁死忙阶段。然而表现,冷冻箱日期拉长了后,牛羊肉片的密度在第5天和第6天正相关性走低;持水实力消减;红颜色变深,没有色泽,鲜黑色转换成暗黑色。不仅,矿酸铁、特异性氧和MDA的成分正相关性添加,肿瘤人体细胞凋亡率正相关性偏高。 实验职工生成各种不同的于食品冷藏周期的腿部胸肌样机的球高蛋清,第二步来进行SDS-PAGE剖析,球高蛋清条带在各种不同的于南北朝时期地理分布匀称且相仿(图1a)。结合球蛋清在各种不同的于样机中的抒出现状,剖析出现某个组样机的中五位数说出于某个品质(图1b),表示腿部胸肌样机球高蛋清极具不错的组内相仿性和组间差距性。 蛋清酶质组学共司法检测出1996种蛋清酶质。以B0为比组,建立B1、B2、B4和B6中的蛋清酶完成性别差异表答分享,共司法检测到37七个DEPs。将火山图数据可视化,并跟据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05一个标准规范分享DEP。最后信息显示如1c-f图甲中,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别司法检测出22、33、73和140个DEPs,表中分刘海别上浮6、11、32和83个,调低16、22、41和54个。聚类算法技巧估评了性别差异保鲜冷库阶段性肌肤机构中蛋清酶质的表答,最后信息显示信息显示肌肤蛋清酶表答性别差异因为补充用时的不断多而不断多(图1g)。
图1| 不相同冷冻箱时段的肌肉群产品的样品血清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不同于保鲜冷库精力的相关肌肉合格品差异性蛋清介绍(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死掉蛋白质肽的PRM按量解析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 由于KEGG含有差别展示蛋清的铁窒息死亡共识机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱菌物提供了TMT参考值血清质组学水平设备,拜谱生物制品已生产制造完全并保持了健全完善发育成熟的转录组学、血清组学、消化吸收组学相应几组学整合设备水平设备风险管理体系,欢迎致电咨询!
考虑文献资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.